鼻咽癌的治療方面，由於鼻咽深入頭顱中央，早在四、五十年前開始，已經主要採用放射治療（即電療）去根治。尤其早期發現的鼻咽癌，一般都以放射治療及化療醫治，若經過放射治療及化療效果未如理想，則可能轉介耳鼻喉科醫生進行鼻咽的切除手術。

鼻咽癌的放射治療，最擔心的是鼻咽附近有很多重要的組織，例如頭顱骶骨後面已經是腦幹，而大腦及眼球亦非常接近，所以放射治療時要避免重要的組織受影響。幸好隨著技術發展，現時的放射治療已愈來愈精準，可以用一個「劑量調控」的方法，將輻射盡量集中在鼻咽的位置。當然，治療的時候並不會單純治療鼻咽的位置，無論病人頸部淋巴核有沒有找到癌細胞，放射治療時都會覆蓋頸部淋巴，但就會避免輻射影響腦幹、眼球及口水腺，希望減少治療後的副作用。

進行放射治療的時候，會預先替病人造一個面罩，這是度身訂造的，務求最切合病人的面形和大小，這樣可確保在整個放射治療的療程中，每次電療的範圍都一樣，不會因為病人某次位置變動而影響了治療的位置，所以是比較精準的。

過往未有這種精準治療，為了確保放射治療覆蓋全部腫瘤，整個放射治療的範圍自然比較大，因而副作用也較多。現時精準治療的長遠副作用，比過往大大減少了。

整體來說，鼻咽癌若能及早介入治療，例如第一期或第二期便開始，現時根治的機會高達八、九成，主要就是得力與近年發展的精準放射治療，以及大家對鼻咽癌的意識提高，能在較早期發現。